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新华社武汉8月2日电(记者侯文坤)记者近日从中国农业科学院油料作物研究所获悉,该所油料作物基因组学与抗病改良创新团队成功破译了油菜基因组全转录信息编码,构建了油菜10多万个基因的转录全景图,使油菜功能基因的研究首次拥有了一个相对标准的基因转录数据库,为相关研究提供了有力支持。研究结果最近发表在国际知名期刊《植物杂志》的网上。
据参与研究的相关研究人员介绍,油菜基因组包含约12亿个碱基和10多万个基因,如何解读这些海量的基因组信息已成为功能基因研究的一项重要任务。根据分子生物学的中心法则,基因被转录成mrna(信使核糖核酸),然后翻译成蛋白质。由于基因转录中存在多种可变切割模式,一个基因可以形成多种不同的mrna。以前,由于技术和资源的限制,油菜一直缺乏全基因组水平上所有基因的转录mrna数据库,导致油菜功能基因研究中缺乏可搜索和可参考的基因注释信息。
为了突破这一瓶颈,中国农业科学院油料作物研究所油料作物基因组学与抗病改良创新团队利用最新的三代测序技术准确测定了油菜的全长转录组,自主开发了一套多倍体油菜复合基因组的分型方法,成功绘制了油菜基因组的转录全景图,构建了油菜基因转录数据库。该研究成果更新了人们对油菜基因和基因组的认识和理解,将为油菜功能基因研究和遗传改良、基因组设计和育种提供数据基础和理论指导。
来源:搜狐微门户
标题:中国科研人员构建油菜基因转录数据库
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